This is the complete list of members for BitArray, including all inherited members.
all_off() | BitArray | inlinestatic |
all_on() | BitArray | inlinestatic |
bit(int index) | BitArray | inlinestatic |
BitArray() (defined in BitArray) | BitArray | inline |
BitArray(WordType init_value) (defined in BitArray) | BitArray | inline |
BitArray(const SparseArray &from) (defined in BitArray) | BitArray | |
clear() | BitArray | inline |
clear_bit(int index) | BitArray | inline |
clear_range(int low_bit, int size) | BitArray | |
compare_to(const BitArray &other) const | BitArray | |
extract(int low_bit, int size) const | BitArray | inline |
generate_hash(ChecksumHashGenerator &hashgen) const | BitArray | |
get_bit(int index) const | BitArray | inline |
get_class_type() (defined in BitArray) | BitArray | inlinestatic |
get_highest_bits() const | BitArray | inline |
get_highest_off_bit() const | BitArray | |
get_highest_on_bit() const | BitArray | |
get_lowest_off_bit() const | BitArray | |
get_lowest_on_bit() const | BitArray | |
get_max_num_bits() (defined in BitArray) | BitArray | inlinestatic |
get_next_higher_different_bit(int low_bit) const | BitArray | |
get_num_bits() const | BitArray | inline |
get_num_bits_per_word() (defined in BitArray) | BitArray | inlinestatic |
get_num_off_bits() const | BitArray | |
get_num_on_bits() const | BitArray | |
get_num_words() const | BitArray | inline |
get_word(size_t n) const | BitArray | inline |
has_all_of(int low_bit, int size) const | BitArray | |
has_any_of(int low_bit, int size) const | BitArray | |
has_bits_in_common(const BitArray &other) const | BitArray | |
has_max_num_bits() (defined in BitArray) | BitArray | inlinestatic |
init_type() (defined in BitArray) | BitArray | inlinestatic |
invert_in_place() | BitArray | |
is_all_on() const | BitArray | |
is_zero() const | BitArray | |
lower_on(int on_bits) | BitArray | inlinestatic |
MaskType typedef (defined in BitArray) | BitArray | |
num_bits_per_word enum value (defined in BitArray) | BitArray | |
operator !=(const BitArray &other) const (defined in BitArray) | BitArray | inline |
operator &(const BitArray &other) const (defined in BitArray) | BitArray | inline |
operator &=(const BitArray &other) (defined in BitArray) | BitArray | |
operator >>(int shift) const (defined in BitArray) | BitArray | inline |
operator >>=(int shift) | BitArray | |
operator ^(const BitArray &other) const (defined in BitArray) | BitArray | inline |
operator ^=(const BitArray &other) (defined in BitArray) | BitArray | |
operator ~() const (defined in BitArray) | BitArray | inline |
operator<(const BitArray &other) const | BitArray | inline |
operator<<(int shift) const (defined in BitArray) | BitArray | inline |
operator<<=(int shift) | BitArray | |
operator==(const BitArray &other) const (defined in BitArray) | BitArray | inline |
operator|(const BitArray &other) const (defined in BitArray) | BitArray | inline |
operator|=(const BitArray &other) (defined in BitArray) | BitArray | |
output(std::ostream &out) const | BitArray | |
output_binary(std::ostream &out, int spaces_every=4) const | BitArray | |
output_hex(std::ostream &out, int spaces_every=4) const | BitArray | |
range(int low_bit, int size) | BitArray | inlinestatic |
read_datagram(DatagramIterator &scan, BamReader *manager) | BitArray | |
set_bit(int index) | BitArray | inline |
set_bit_to(int index, bool value) | BitArray | inline |
set_range(int low_bit, int size) | BitArray | |
set_range_to(bool value, int low_bit, int size) | BitArray | inline |
set_word(size_t n, WordType value) | BitArray | inline |
store(WordType value, int low_bit, int size) | BitArray | inline |
WordType typedef (defined in BitArray) | BitArray | |
write(std::ostream &out, int indent_level=0) const | BitArray | |
write_datagram(BamWriter *manager, Datagram &dg) const | BitArray |